%0 Journal Article %K veterinary bacterial isolates %K Biotyper %K conventional methods %B Berliner und Münchener Tierärztliche Wochenschrift %C Hannover %D 2015 %G English %I Schlütersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG %P 24-30 %R 10.2376/0005-9366-128-24 %T Identification of bacteria isolated from veterinary clinical specimens using MALDI-TOF MS %V 128 %1 {"oldId":84548,"title":"Identification of bacteria isolated from veterinary clinical specimens using MALDI-TOF MS","topline":"","teaserText":"Identifizierung von bakteriellen Isolaten veterin\u00e4ren Ursprungs mit MALDI-TOF MS","content":"

Summary<\/span>
Matrix-assisted laser desorption\/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has recently emerged as a rapid and accurate identification method for bacterial species. Although it has been successfully applied for the identification of human pathogens, it has so far not been well evaluated for routine identification of veterinary bacterial isolates. This study was performed to compare and evaluate the performance of MALDI-TOF MS based identification of veterinary bacterial isolates with commercially available conventional test systems. Discrepancies of both methods were resolved by sequencing 16S rDNA and, if necessary, the infB gene for Actinobacillus isolates. A total of 375 consecutively isolated veterinary samples were collected. Among the 357 isolates (95.2%) correctly identified at the genus level by MALDI-TOF MS, 338 of them (90.1% of the total isolates) were also correctly identified at the species level. Conventional methods offered correct species identification for 319 isolates (85.1%). MALDI-TOF identification therefore offered more accurate identification of veterinary bacterial isolates. An update of the in-house mass spectra database with additional reference spectra clearly improved the identification results. In conclusion, the presented data suggest that MALDITOF MS is an appropriate platform for classification and identification of veterinary bacterial isolates. <\/p>

Keywords<\/span>
veterinary bacterial isolates, Biotyper, conventional methods<\/p>

Zusammenfassung<\/span>
Die Matrix-unterst\u00fctzte Laser-Desorptions\/Ionisations Massenspektrometrie (MALDI-TOF MS) ist eine schnelle Methode zur akkuraten Identifizierung bakterieller Isolate. Obwohl diese Methode bereits erfolgreich zur Identifizierung humaner Isolate eingesetzt wird, wurde ihre Eignung noch nicht f\u00fcr die Identifizierung von Isolaten aus dem Bereich der Veterin\u00e4rmedizin in der Routineanalytik evaluiert. Ziel dieser Studie war es die Leistungsf\u00e4higkeit von MALDI-TOF MS f\u00fcr derartige Isolate mit konventionellen Testsystemen zu vergleichen und zu evaluieren. Widerspr\u00fcche im Identifizierungsergebnis zwischen den beiden Methoden wurden durch Sequenzierung der 16S rDNA und, wenn notwendig, eines Genabschnitts des infB-Gens f\u00fcr Isolate der Gattung Actinobacillus aufgel\u00f6st. Insgesamt wurden 375 bakterielle Isolate veterin\u00e4ren Ursprungs aus der Routineanalytik gesammelt. Von den 357 Isolaten (95,2 %), die auf Gattungsebene mit MALDI-TOF MS richtig identifiziert wurden, wurden 338 Isolate (90,1 % der Gesamtisolate) auch auf Speziesebene richtig identifiziert. Konventionelle Methoden f\u00fchrten zur korrekten Speziesidentifizierung von 319 Isolaten (85,1 %). Demnach war der Anteil der nicht korrekten Identifizierungen mit MALDI-TOF MS geringer als mit konventionellen Methoden. Die Erg\u00e4nzung der internen Spektren-Datenbank des Bayerischen Landesamtes f\u00fcr Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL) mit eigenen Referenzspektren hat die Identifizierungsergebnisse deutlich verbessert. Die hier vorgestellten Daten legen nahe, dass MALDI-TOF MS eine geeignete Plattform zur Klassifizierung und Identifizierung von bakteriellen Isolaten veterin\u00e4ren Ursprungs ist. <\/p>

Schl\u00fcsselw\u00f6rter<\/span>
Veterin\u00e4risolate, Biotyper, konventionelle Methoden<\/p>","categories":["Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","Abostufe BMTW","Fachartikel"],"fromDate":"Jan 11, 2015 1:22:39 PM","oldUrls":["http:\/\/vetline.de\/identification-of-bacteria-isolated-from-veterinary-clinical-specimens-using-maldi-tof-ms\/150\/3130\/84548"],"doiLanguage":"englisch","doiProductFormat":"online","doiPublisher":"Schl\u00fctersche Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG","doiSerialWorkTitle":"Berliner und M\u00fcnchener Tier\u00e4rztliche Wochenschrift","doiDocumentUri":"http:\/\/www.vetline.de\/identification-of-bacteria-isolated-from-veterinary-clinical-specimens-using-maldi-tof-ms\/150\/3130\/84548\/","doiSource":"Berl M\u00fcnch Tier\u00e4rztl Wochenschr 128, 22\u201330 (2015) ","doiissn":"0005-9366","doiNr":"10.2376\/0005-9366-128-24","doiFirstPage":"24","doiLastPage":"30","doiTransmitted":true,"doiAuthor":"Pavlovic M, Wudy C, Zeller-Peronnet V, Maggipinto M, Zimmermann P, Straubinger A, Iwobi A, M\u00e4rtlbauer E, Busch U, Huber I","pdf":{"path":"http:\/\/data\/BMW_2015_01_02_0024.pdf","title":"BMW_2015_01_02_0024.pdf","description":"Identification of bacteria isolated from veterinary clinical specimens using MALDI-TOF MS"},"authors":[{"firstName":"M","middleName":"","lastName":"Pavlovic"},{"firstName":"C","middleName":"","lastName":"Wudy"},{"firstName":"V","middleName":"","lastName":"Zeller-Peronnet"},{"firstName":"M","middleName":"","lastName":"Maggipinto"},{"firstName":"P","middleName":"","lastName":"Zimmermann"},{"firstName":"A","middleName":"","lastName":"Straubinger"},{"firstName":"A","middleName":"","lastName":"Iwobi"},{"firstName":"E","middleName":"","lastName":"M\u00e4rtlbauer"},{"firstName":"U","middleName":"","lastName":"Busch"},{"firstName":"I","middleName":"","lastName":"Huber"}],"contentOptimised":"

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Matrix-assisted laser desorption\/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has recently emerged as a rapid and accurate identification method for bacterial species. Although it has been successfully applied for the identification of human pathogens, it has so far not been well evaluated for routine identification of veterinary bacterial isolates. This study was performed to compare and evaluate the performance of MALDI-TOF MS based identification of veterinary bacterial isolates with commercially available conventional test systems. Discrepancies of both methods were resolved by sequencing 16S rDNA and, if necessary, the infB gene for Actinobacillus isolates. A total of 375 consecutively isolated veterinary samples were collected. Among the 357 isolates (95.2%) correctly identified at the genus level by MALDI-TOF MS, 338 of them (90.1% of the total isolates) were also correctly identified at the species level. Conventional methods offered correct species identification for 319 isolates (85.1%). MALDI-TOF identification therefore offered more accurate identification of veterinary bacterial isolates. An update of the in-house mass spectra database with additional reference spectra clearly improved the identification results. In conclusion, the presented data suggest that MALDITOF MS is an appropriate platform for classification and identification of veterinary bacterial isolates. <\/p>

Keywords:<\/strong>
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Zusammenfassung<\/strong>
Die Matrix-unterst\u00fctzte Laser-Desorptions\/Ionisations Massenspektrometrie (MALDI-TOF MS) ist eine schnelle Methode zur akkuraten Identifizierung bakterieller Isolate. Obwohl diese Methode bereits erfolgreich zur Identifizierung humaner Isolate eingesetzt wird, wurde ihre Eignung noch nicht f\u00fcr die Identifizierung von Isolaten aus dem Bereich der Veterin\u00e4rmedizin in der Routineanalytik evaluiert. Ziel dieser Studie war es die Leistungsf\u00e4higkeit von MALDI-TOF MS f\u00fcr derartige Isolate mit konventionellen Testsystemen zu vergleichen und zu evaluieren. Widerspr\u00fcche im Identifizierungsergebnis zwischen den beiden Methoden wurden durch Sequenzierung der 16S rDNA und, wenn notwendig, eines Genabschnitts des infB-Gens f\u00fcr Isolate der Gattung Actinobacillus aufgel\u00f6st. Insgesamt wurden 375 bakterielle Isolate veterin\u00e4ren Ursprungs aus der Routineanalytik gesammelt. Von den 357 Isolaten (95,2 %), die auf Gattungsebene mit MALDI-TOF MS richtig identifiziert wurden, wurden 338 Isolate (90,1 % der Gesamtisolate) auch auf Speziesebene richtig identifiziert. Konventionelle Methoden f\u00fchrten zur korrekten Speziesidentifizierung von 319 Isolaten (85,1 %). Demnach war der Anteil der nicht korrekten Identifizierungen mit MALDI-TOF MS geringer als mit konventionellen Methoden. Die Erg\u00e4nzung der internen Spektren-Datenbank des Bayerischen Landesamtes f\u00fcr Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL) mit eigenen Referenzspektren hat die Identifizierungsergebnisse deutlich verbessert. Die hier vorgestellten Daten legen nahe, dass MALDI-TOF MS eine geeignete Plattform zur Klassifizierung und Identifizierung von bakteriellen Isolaten veterin\u00e4ren Ursprungs ist. <\/p>

Schl\u00fcsselw\u00f6rter:<\/strong>
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